Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpnP63163 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SnrpnP63163 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SnrpnP63163 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms