Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabrb3P63080 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabrb3P63080 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gabrb3P63080 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabrb3P63080 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabrb3P63080 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabrb3P63080 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabrb3P63080 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabrb3P63080 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabrb3P63080 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabrb3P63080 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms