Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp3P63024 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms