Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps3P62908 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps3P62908 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps3P62908 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps3P62908 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps3P62908 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps3P62908 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps3P62908 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps3P62908 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms