Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpd1P62315 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd1P62315 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd1P62315 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd1P62315 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd1P62315 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snrpd1P62315 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms