Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp46P62069 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp46P62069 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp46P62069 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp46P62069 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp46P62069 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp46P62069 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp46P62069 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp46P62069 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp46P62069 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp46P62069 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp46P62069 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms