Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmo4P61969 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo4P61969 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms