Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufm1P61961 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufm1P61961 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufm1P61961 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms