Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem258P61166 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem258P61166 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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