Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b6P59708 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b6P59708 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms