Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripk2P58801 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ripk2P58801 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripk2P58801 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ripk2P58801 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ripk2P58801 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ripk2P58801 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ripk2P58801 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ripk2P58801 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk2P58801 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ripk2P58801 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk2P58801 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms