Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NcstnP57716 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NcstnP57716 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NcstnP57716 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NcstnP57716 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NcstnP57716 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
NcstnP57716 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NcstnP57716 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NcstnP57716 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NcstnP57716 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NcstnP57716 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NcstnP57716 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NcstnP57716 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NcstnP57716 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NcstnP57716 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NcstnP57716 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NcstnP57716 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NcstnP57716 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NcstnP57716 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NcstnP57716 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NcstnP57716 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NcstnP57716 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NcstnP57716 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NcstnP57716 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NcstnP57716 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NcstnP57716 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NcstnP57716 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NcstnP57716 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NcstnP57716 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NcstnP57716 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NcstnP57716 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NcstnP57716 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NcstnP57716 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms