Protein–RNA interactions for Protein: P56655

Cyp2c38, Cytochrome P450 2C38, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c38P56655 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c38P56655 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c38P56655 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c38P56655 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms