Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lim2P56563 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lim2P56563 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lim2P56563 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Lim2P56563 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lim2P56563 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lim2P56563 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lim2P56563 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lim2P56563 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lim2P56563 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lim2P56563 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lim2P56563 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lim2P56563 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms