Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctbp2P56546 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctbp2P56546 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms