Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd38P56528 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd38P56528 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd38P56528 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd38P56528 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd38P56528 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd38P56528 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd38P56528 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd38P56528 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd38P56528 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd38P56528 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms