Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GferP56213 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GferP56213 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GferP56213 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GferP56213 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GferP56213 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GferP56213 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GferP56213 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GferP56213 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GferP56213 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GferP56213 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GferP56213 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GferP56213 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GferP56213 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GferP56213 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GferP56213 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GferP56213 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GferP56213 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GferP56213 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GferP56213 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GferP56213 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GferP56213 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GferP56213 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GferP56213 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GferP56213 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GferP56213 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GferP56213 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GferP56213 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GferP56213 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GferP56213 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GferP56213 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GferP56213 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GferP56213 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GferP56213 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GferP56213 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GferP56213 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GferP56213 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GferP56213 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GferP56213 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GferP56213 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GferP56213 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GferP56213 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GferP56213 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GferP56213 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GferP56213 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GferP56213 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GferP56213 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GferP56213 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GferP56213 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GferP56213 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GferP56213 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GferP56213 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GferP56213 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GferP56213 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GferP56213 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GferP56213 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms