Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NcanP55066 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NcanP55066 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NcanP55066 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NcanP55066 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NcanP55066 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NcanP55066 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NcanP55066 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcanP55066 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcanP55066 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcanP55066 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcanP55066 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcanP55066 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcanP55066 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcanP55066 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcanP55066 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcanP55066 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcanP55066 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcanP55066 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcanP55066 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcanP55066 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcanP55066 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcanP55066 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcanP55066 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcanP55066 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NcanP55066 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NcanP55066 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NcanP55066 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NcanP55066 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcanP55066 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcanP55066 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcanP55066 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NcanP55066 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcanP55066 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcanP55066 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcanP55066 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcanP55066 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcanP55066 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NcanP55066 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NcanP55066 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NcanP55066 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NcanP55066 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NcanP55066 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NcanP55066 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NcanP55066 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NcanP55066 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcanP55066 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcanP55066 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcanP55066 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcanP55066 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcanP55066 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NcanP55066 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcanP55066 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcanP55066 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcanP55066 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcanP55066 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcanP55066 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcanP55066 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcanP55066 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NcanP55066 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcanP55066 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcanP55066 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcanP55066 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcanP55066 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcanP55066 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NcanP55066 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NcanP55066 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NcanP55066 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NcanP55066 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NcanP55066 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcanP55066 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcanP55066 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcanP55066 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcanP55066 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcanP55066 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcanP55066 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NcanP55066 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcanP55066 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcanP55066 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcanP55066 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcanP55066 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcanP55066 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcanP55066 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcanP55066 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NcanP55066 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcanP55066 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcanP55066 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcanP55066 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1032 ms