Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NrlP54846 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NrlP54846 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NrlP54846 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NrlP54846 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NrlP54846 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NrlP54846 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NrlP54846 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NrlP54846 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NrlP54846 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NrlP54846 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NrlP54846 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NrlP54846 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NrlP54846 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NrlP54846 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrlP54846 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrlP54846 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrlP54846 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrlP54846 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrlP54846 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrlP54846 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NrlP54846 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NrlP54846 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NrlP54846 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NrlP54846 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NrlP54846 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NrlP54846 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NrlP54846 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NrlP54846 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrlP54846 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrlP54846 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrlP54846 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrlP54846 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NrlP54846 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrlP54846 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrlP54846 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrlP54846 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrlP54846 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrlP54846 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NrlP54846 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrlP54846 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrlP54846 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrlP54846 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrlP54846 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NrlP54846 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NrlP54846 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NrlP54846 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NrlP54846 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NrlP54846 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NrlP54846 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NrlP54846 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NrlP54846 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NrlP54846 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrlP54846 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrlP54846 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrlP54846 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrlP54846 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrlP54846 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrlP54846 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrlP54846 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrlP54846 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrlP54846 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrlP54846 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrlP54846 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrlP54846 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrlP54846 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrlP54846 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrlP54846 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrlP54846 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrlP54846 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrlP54846 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrlP54846 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrlP54846 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NrlP54846 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrlP54846 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrlP54846 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NrlP54846 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrlP54846 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrlP54846 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrlP54846 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NrlP54846 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NrlP54846 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NrlP54846 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrlP54846 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrlP54846 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrlP54846 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrlP54846 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrlP54846 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrlP54846 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NrlP54846 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrlP54846 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrlP54846 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrlP54846 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrlP54846 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrlP54846 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrlP54846 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NrlP54846 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NrlP54846 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NrlP54846 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NrlP54846 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms