Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad23aP54726 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad23aP54726 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad23aP54726 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms