Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacnb3P54285 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacnb3P54285 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacnb3P54285 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms