Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Stmn1P54227 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stmn1P54227 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stmn1P54227 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms