Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PitpnbP53811 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PitpnbP53811 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PitpnbP53811 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PitpnbP53811 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PitpnbP53811 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PitpnbP53811 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms