Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PklrP53657 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PklrP53657 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PklrP53657 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PklrP53657 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PklrP53657 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PklrP53657 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PklrP53657 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PklrP53657 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PklrP53657 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PklrP53657 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PklrP53657 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PklrP53657 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PklrP53657 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PklrP53657 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PklrP53657 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PklrP53657 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PklrP53657 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PklrP53657 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PklrP53657 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PklrP53657 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PklrP53657 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PklrP53657 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PklrP53657 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PklrP53657 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PklrP53657 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PklrP53657 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PklrP53657 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PklrP53657 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PklrP53657 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PklrP53657 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PklrP53657 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PklrP53657 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PklrP53657 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PklrP53657 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PklrP53657 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PklrP53657 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PklrP53657 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PklrP53657 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PklrP53657 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PklrP53657 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PklrP53657 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PklrP53657 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PklrP53657 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PklrP53657 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PklrP53657 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PklrP53657 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PklrP53657 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PklrP53657 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PklrP53657 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PklrP53657 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PklrP53657 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PklrP53657 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PklrP53657 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PklrP53657 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PklrP53657 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PklrP53657 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PklrP53657 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PklrP53657 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PklrP53657 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PklrP53657 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PklrP53657 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PklrP53657 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PklrP53657 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PklrP53657 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PklrP53657 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PklrP53657 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PklrP53657 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PklrP53657 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PklrP53657 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PklrP53657 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PklrP53657 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PklrP53657 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PklrP53657 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PklrP53657 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PklrP53657 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms