Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa9P50707 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa9P50707 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa9P50707 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa9P50707 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa9P50707 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa9P50707 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms