Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa8P50706 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa8P50706 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa8P50706 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa8P50706 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa8P50706 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa8P50706 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa8P50706 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms