Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FanccP50652 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FanccP50652 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FanccP50652 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FanccP50652 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FanccP50652 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FanccP50652 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FanccP50652 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FanccP50652 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FanccP50652 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FanccP50652 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FanccP50652 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FanccP50652 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FanccP50652 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FanccP50652 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FanccP50652 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FanccP50652 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FanccP50652 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FanccP50652 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FanccP50652 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FanccP50652 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FanccP50652 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FanccP50652 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanccP50652 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanccP50652 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanccP50652 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanccP50652 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FanccP50652 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanccP50652 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanccP50652 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanccP50652 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FanccP50652 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanccP50652 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanccP50652 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanccP50652 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanccP50652 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanccP50652 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanccP50652 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FanccP50652 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanccP50652 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanccP50652 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FanccP50652 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanccP50652 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanccP50652 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanccP50652 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanccP50652 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanccP50652 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanccP50652 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FanccP50652 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanccP50652 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FanccP50652 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanccP50652 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanccP50652 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanccP50652 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanccP50652 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FanccP50652 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanccP50652 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FanccP50652 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FanccP50652 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FanccP50652 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanccP50652 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanccP50652 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FanccP50652 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FanccP50652 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FanccP50652 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FanccP50652 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FanccP50652 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FanccP50652 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FanccP50652 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FanccP50652 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FanccP50652 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FanccP50652 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FanccP50652 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FanccP50652 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FanccP50652 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FanccP50652 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FanccP50652 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FanccP50652 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FanccP50652 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FanccP50652 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FanccP50652 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FanccP50652 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FanccP50652 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FanccP50652 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FanccP50652 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FanccP50652 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FanccP50652 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FanccP50652 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FanccP50652 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FanccP50652 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms