Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FmodP50608 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FmodP50608 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FmodP50608 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FmodP50608 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FmodP50608 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FmodP50608 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FmodP50608 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FmodP50608 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FmodP50608 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FmodP50608 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FmodP50608 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FmodP50608 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FmodP50608 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FmodP50608 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FmodP50608 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FmodP50608 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FmodP50608 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FmodP50608 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FmodP50608 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FmodP50608 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FmodP50608 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FmodP50608 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FmodP50608 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FmodP50608 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FmodP50608 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FmodP50608 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FmodP50608 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FmodP50608 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FmodP50608 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FmodP50608 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FmodP50608 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FmodP50608 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FmodP50608 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FmodP50608 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FmodP50608 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FmodP50608 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FmodP50608 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FmodP50608 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FmodP50608 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FmodP50608 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FmodP50608 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FmodP50608 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FmodP50608 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FmodP50608 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FmodP50608 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FmodP50608 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FmodP50608 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FmodP50608 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FmodP50608 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FmodP50608 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FmodP50608 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FmodP50608 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FmodP50608 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FmodP50608 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FmodP50608 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FmodP50608 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FmodP50608 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FmodP50608 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FmodP50608 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FmodP50608 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms