Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdi1P50396 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms