Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd7P50283 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd7P50283 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd7P50283 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd7P50283 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd7P50283 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd7P50283 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd7P50283 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd7P50283 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms