Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cav1P49817 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cav1P49817 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cav1P49817 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cav1P49817 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cav1P49817 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cav1P49817 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cav1P49817 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cav1P49817 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cav1P49817 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cav1P49817 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav1P49817 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cav1P49817 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cav1P49817 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav1P49817 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cav1P49817 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cav1P49817 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cav1P49817 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cav1P49817 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms