Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CitP49025 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CitP49025 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CitP49025 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CitP49025 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CitP49025 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CitP49025 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CitP49025 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CitP49025 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CitP49025 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CitP49025 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CitP49025 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CitP49025 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CitP49025 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CitP49025 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CitP49025 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CitP49025 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CitP49025 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CitP49025 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CitP49025 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CitP49025 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CitP49025 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CitP49025 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CitP49025 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CitP49025 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CitP49025 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CitP49025 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CitP49025 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CitP49025 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CitP49025 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CitP49025 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CitP49025 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CitP49025 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CitP49025 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CitP49025 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CitP49025 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CitP49025 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CitP49025 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CitP49025 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CitP49025 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CitP49025 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CitP49025 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CitP49025 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CitP49025 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CitP49025 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CitP49025 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CitP49025 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CitP49025 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CitP49025 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CitP49025 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CitP49025 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CitP49025 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CitP49025 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CitP49025 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CitP49025 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CitP49025 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CitP49025 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CitP49025 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CitP49025 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CitP49025 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CitP49025 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CitP49025 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CitP49025 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CitP49025 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CitP49025 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CitP49025 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CitP49025 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CitP49025 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CitP49025 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CitP49025 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CitP49025 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CitP49025 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CitP49025 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CitP49025 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CitP49025 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CitP49025 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CitP49025 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CitP49025 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CitP49025 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CitP49025 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CitP49025 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CitP49025 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CitP49025 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CitP49025 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CitP49025 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CitP49025 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CitP49025 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CitP49025 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CitP49025 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CitP49025 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms