Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnni3P48787 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3P48787 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms