Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx2P48379 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms