Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rfx1P48377 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx1P48377 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx1P48377 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms