Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrprbP47758 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrprbP47758 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SrprbP47758 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrprbP47758 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrprbP47758 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrprbP47758 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrprbP47758 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrprbP47758 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SrprbP47758 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrprbP47758 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrprbP47758 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.3 ms