Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsfP46460 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsfP46460 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsfP46460 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsfP46460 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsfP46460 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsfP46460 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsfP46460 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsfP46460 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsfP46460 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsfP46460 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsfP46460 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NsfP46460 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsfP46460 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsfP46460 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsfP46460 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsfP46460 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsfP46460 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsfP46460 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsfP46460 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsfP46460 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsfP46460 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsfP46460 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsfP46460 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsfP46460 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsfP46460 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsfP46460 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsfP46460 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsfP46460 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsfP46460 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsfP46460 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsfP46460 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsfP46460 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsfP46460 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsfP46460 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsfP46460 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsfP46460 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsfP46460 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsfP46460 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsfP46460 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsfP46460 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NsfP46460 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsfP46460 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsfP46460 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsfP46460 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsfP46460 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NsfP46460 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NsfP46460 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NsfP46460 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NsfP46460 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsfP46460 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsfP46460 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsfP46460 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsfP46460 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsfP46460 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsfP46460 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsfP46460 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsfP46460 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsfP46460 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsfP46460 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsfP46460 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsfP46460 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsfP46460 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsfP46460 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsfP46460 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsfP46460 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsfP46460 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsfP46460 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsfP46460 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsfP46460 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsfP46460 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsfP46460 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsfP46460 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsfP46460 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsfP46460 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsfP46460 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsfP46460 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NsfP46460 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NsfP46460 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NsfP46460 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NsfP46460 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NsfP46460 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NsfP46460 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NsfP46460 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NsfP46460 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NsfP46460 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsfP46460 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsfP46460 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsfP46460 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms