Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr2f2P43135 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2f2P43135 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr2f2P43135 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.5 ms