Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tac1P41539 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tac1P41539 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tac1P41539 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tac1P41539 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tac1P41539 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tac1P41539 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tac1P41539 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tac1P41539 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tac1P41539 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms