Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CskP41241 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CskP41241 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CskP41241 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CskP41241 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CskP41241 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CskP41241 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CskP41241 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CskP41241 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CskP41241 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CskP41241 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CskP41241 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CskP41241 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CskP41241 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CskP41241 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CskP41241 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CskP41241 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CskP41241 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CskP41241 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CskP41241 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CskP41241 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CskP41241 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CskP41241 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CskP41241 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CskP41241 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CskP41241 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CskP41241 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CskP41241 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CskP41241 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CskP41241 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CskP41241 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CskP41241 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CskP41241 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CskP41241 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CskP41241 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CskP41241 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CskP41241 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CskP41241 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CskP41241 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CskP41241 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CskP41241 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CskP41241 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CskP41241 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CskP41241 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CskP41241 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CskP41241 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CskP41241 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CskP41241 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CskP41241 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CskP41241 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CskP41241 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CskP41241 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CskP41241 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CskP41241 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CskP41241 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CskP41241 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CskP41241 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CskP41241 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CskP41241 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CskP41241 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CskP41241 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CskP41241 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CskP41241 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CskP41241 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CskP41241 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CskP41241 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CskP41241 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CskP41241 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CskP41241 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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