Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ThpoP40226 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ThpoP40226 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ThpoP40226 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ThpoP40226 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ThpoP40226 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ThpoP40226 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ThpoP40226 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ThpoP40226 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ThpoP40226 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ThpoP40226 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms