Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox5P35710 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox5P35710 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox5P35710 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox5P35710 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox5P35710 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox5P35710 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox5P35710 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox5P35710 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.9 ms