Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grin1P35438 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin1P35438 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin1P35438 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin1P35438 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin1P35438 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms