Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PpardP35396 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PpardP35396 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PpardP35396 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PpardP35396 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PpardP35396 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PpardP35396 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PpardP35396 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PpardP35396 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PpardP35396 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PpardP35396 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PpardP35396 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PpardP35396 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PpardP35396 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PpardP35396 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PpardP35396 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PpardP35396 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PpardP35396 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpardP35396 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpardP35396 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpardP35396 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpardP35396 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpardP35396 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpardP35396 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpardP35396 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpardP35396 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpardP35396 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpardP35396 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpardP35396 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpardP35396 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpardP35396 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpardP35396 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PpardP35396 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpardP35396 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpardP35396 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpardP35396 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpardP35396 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpardP35396 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpardP35396 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PpardP35396 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PpardP35396 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PpardP35396 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpardP35396 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpardP35396 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpardP35396 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpardP35396 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpardP35396 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpardP35396 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpardP35396 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpardP35396 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PpardP35396 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PpardP35396 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PpardP35396 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PpardP35396 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PpardP35396 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PpardP35396 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PpardP35396 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpardP35396 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpardP35396 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpardP35396 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpardP35396 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpardP35396 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpardP35396 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpardP35396 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpardP35396 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpardP35396 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpardP35396 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpardP35396 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpardP35396 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpardP35396 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpardP35396 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpardP35396 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpardP35396 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpardP35396 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PpardP35396 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpardP35396 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpardP35396 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpardP35396 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpardP35396 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpardP35396 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PpardP35396 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PpardP35396 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PpardP35396 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PpardP35396 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PpardP35396 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PpardP35396 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PpardP35396 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PpardP35396 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PpardP35396 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PpardP35396 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms