Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab23P35288 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab23P35288 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab23P35288 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab23P35288 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab23P35288 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab23P35288 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab23P35288 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab23P35288 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab23P35288 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rab23P35288 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab23P35288 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms