Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stfa3P35173 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Stfa3P35173 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Stfa3P35173 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms