Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoc1P34928 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc1P34928 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms