Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifnar1P33896 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifnar1P33896 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ifnar1P33896 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifnar1P33896 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms