Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoc3P33622 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms