Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KrasP32883 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KrasP32883 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KrasP32883 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KrasP32883 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KrasP32883 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KrasP32883 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KrasP32883 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KrasP32883 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KrasP32883 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KrasP32883 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KrasP32883 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KrasP32883 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KrasP32883 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KrasP32883 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KrasP32883 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KrasP32883 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KrasP32883 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KrasP32883 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KrasP32883 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KrasP32883 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KrasP32883 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KrasP32883 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KrasP32883 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KrasP32883 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KrasP32883 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KrasP32883 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KrasP32883 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KrasP32883 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KrasP32883 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KrasP32883 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KrasP32883 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KrasP32883 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KrasP32883 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KrasP32883 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KrasP32883 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KrasP32883 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KrasP32883 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KrasP32883 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KrasP32883 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KrasP32883 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KrasP32883 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KrasP32883 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KrasP32883 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KrasP32883 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KrasP32883 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KrasP32883 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KrasP32883 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KrasP32883 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KrasP32883 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KrasP32883 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KrasP32883 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KrasP32883 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KrasP32883 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KrasP32883 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KrasP32883 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KrasP32883 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KrasP32883 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KrasP32883 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KrasP32883 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KrasP32883 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KrasP32883 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KrasP32883 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KrasP32883 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KrasP32883 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KrasP32883 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KrasP32883 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KrasP32883 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KrasP32883 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KrasP32883 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KrasP32883 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KrasP32883 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KrasP32883 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KrasP32883 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KrasP32883 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KrasP32883 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KrasP32883 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KrasP32883 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms